Interreg-programmen finansieras genom europeiska regionala utvecklingsfonden (ERUF). Syftet med Interreg är att stödja samarbete över gränser, interregionalt, och att stötta erfarenhetsutbyte, best practice och för att lösa gemensamma utmaningar. Finansiering ges uteslutande för samverkan över gränser med aktörer från mer än ett land.
Interreg-programmen har regionala ansvariga myndigheter, ibland i ett annat land än Sverige.